O enrolamento da folha é uma doença economicamente importante que afeta videiras (Vitis spp.). Nove vírus sorologicamente distintos, Grapevine leafroll-associated virus-1 a -9, estão associados à doença. Este estudo descreve a seqüência do gene da proteína capsidial de quatro isolados do GLRaV-3 encontrados no Vale do Rio São Francisco, Nordeste do Brasil. O RNA viral foi extraído de plantas positivas em ELISA para o GLRaV-3 e o gene da proteína capsidial completo foi amplificado por RT-PCR. As seqüências foram geradas automaticamente e comparadas a seqüências completas do gene da proteína capsidial de isolados Norte-Americano (NY1) e Chineses (Dawanhong Nº;2 e SL10) de GLRaV-3. Os quatro isolados estudados, denominados Pet-1 a 4, exibiram identidades de aminoácidos deduzidos de 98-100% (Pet-1 a 3) e 95% (Pet-4) com os isolados Norte-Americano e Chineses. Um total de dezessete substituições de aminoácidos foi detectado entre os quatro isolados caracterizados em comparação com as seqüências do NY1, Dawanhong No.2 e SL10. Os resultados indicaram a existência de variação natural entre os isolados de GLRaV-3 de videiras, demonstrando também a falta de correlação entre dados de sequência e origem geográfica. Esta variabilidade deve ser considerada quando se selecionam regiões do genoma viral para uma detecção molecular confiável e consistente.

Leafroll is an economically important disease affecting grapevines (Vitis spp.). Nine serologically distinct viruses, Grapevine leafroll-associated virus-1 through 9, are associated with this disease. The present study describes the coat protein gene sequence of four GLRaV-3 isolates occurring in the São Francisco River basin, Northeastern Brazil. The viral RNA was extracted from GLRaV-3 ELISA-positive plants and the complete coat protein gene was amplified by RT-PCR. Sequences were generated automatically and compared to the complete coat protein sequence from North American (NY1) and Chinese (Dawanhong Nº2 and SL10) GLRaV-3 isolates. The four studied isolates, named Pet-1 through 4, showed deduced amino acid identities of 98-100% (Pet-1 through 3) and 95% (Pet-4) with North American and Chinese isolates. A total of seventeen amino acid substitutions was detected among the four characterized isolates in comparison to the NY1, Dawanhong No.2 and SL10 sequences. The results indicated the existence of natural variation among GLRaV-3 isolates from grapevines, also demonstrating a lack of correlation between sequence data and geographic origin. This variability should be considered when selecting regions of the viral genome targeted for reliable and consistent virus molecular detection.

Neste trabalho foi avaliado o cultivo in vitro de somaclones de abacaxizeiro, na presença de elevadas concentrações de NaCl. Propágulos de abacaxizeiro foram submetidos a um período de cultivo in vitro em diferentes concentrações de NaCl (0, 12,5, 25 e 50 mM). Em seguida, foram cultivados na ausência do sal e, por fim, foram submetidos a um outro período de cultivo in vitro em 0 e 100 mM de NaCl. Não se observou interação entre as concentrações empregadas nos dois períodos de exposição ao NaCl, de modo que propágulos provenientes de tratamentos com concentrações mais elevadas não apresentaram melhor desempenho durante o segundo período de exposição; no entanto, constatou-se alteração negativa para os valores referentes à maioria das variáveis avaliadas em propágulos cultivados na presença de 100 mM de NaCl, na segunda exposição. Ao final do experimento foram selecionadas famílias cultivadas na presença de 100 mM de NaCl, com base na semelhança fenotípica ao controle. As famílias selecionadas eram originárias, igualmente, das quatro concentrações do primeiro período de tratamento com NaCl. Desse modo, as concentrações empregadas no primeiro período de exposição ao NaCl não influenciaram significativamente o crescimento dos propágulos durante o segundo período de cultivo in vitro na presença de NaCl.

This study evaluated the in vitro cultivation of pineapple somaclones under high concentrations of NaCl. Propagules of pineapple were cultivated in presence of different NaCl concentrations (0, 12.5, 25 and 50 mM), then passed through two subcultivations in absence of NaCl, and finally submitted to a second in vitro cultivation under 0 and 100 mM concentrations of NaCl. Interactions between the concentrations of both treatment's periods were not observed. Hence, propagules proceeding from higher concentrations treatments did not show better performance during the second period. A negative response was observed for almost all studied variables by propagules grown in 100 mM NaCl in the second treatment period. At the end of the experimental period, some families cultivated in 100 mM NaCl were selected. These families came equally from the four concentrations of the first treatment period with NaCl. Hence, the concentrations of NaCl applied in the first treatment period did not present significant influence on development of propagules during the second in vitro cultivation period under saline conditions.

A videira (Vitis spp.) é afetada por diversas viroses, dentre essas, o enrolamento da folha se destaca pela importância econômica. A doença é causada por um complexo formado por até oito vírus [Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV) -1 ao -8]. O objetivo desse trabalho foi comparar a variabilidade da extremidade 3' do gene da polimerase de isolados de GLRaV-3, provenientes do Submédio do Vale do Rio São Francisco (Petrolina, PE) com a de outros isolados disponíveis no GenBank, incluindo um isolado da América do Norte e um da região sul do Brasil. O RNA viral foi extraído de três amostras infetadas, reagentes em teste de ELISA, e um fragmento de 340 pb foi amplificado por RT-PCR, utilizando-se oligonucleotídeos para a região do gene da polimerase viral compreendida entre os nucleotídeos 8267 a 8606. Observou-se que os três isolados da região do São Francisco, denominados Pet-1, Pet-2 e Pet-3, apresentaram 98% e 94% de similaridade com o isolado norte-americano (AF037268) com aquele do sul do Brasil (AF438411), respectivamente. A principal variação observada foi uma troca de um aminoácido da posição 2766 (F2766Y), considerando-se o genoma completo. Esses dados preliminares indicam a existência de uma variabilidade natural entre isolados de GLRaV-3 em videiras. Isso pode ser explicado pela propagação vegetativa e pelo longo ciclo da planta associados à propensão ao erro da RNA polimerase dependente de RNA.

Many viral diseases, including leafroll, which is of great economic importance, affect grapevines (Vitis spp.). A complex of eight viruses [Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV) -1 to 8] is associated with this disease. The objective of this study was to compare the variability of the 3' terminal region of the polymerase gene of three isolates of GLRaV-3 (Grapevine leafroll-associated virus-3), from Submédio do Vale do Rio São Francisco (Petrolina-PE) with that of other isolates available at the GenBank, including an isolate from North America and another from Southern Brazil. The viral RNA was extracted from three infected ELISA reactive plants and a fragment of 340 bp was amplified, by RT-PCR, using primers that recognize that portion of the polymerase gene found between nucleotides 8267 and 8606. The three isolates from Vale do Rio São Francisco named Pet-1, Pet-2 and Pet-3, showed similarities ranging from 98% and 94%, respectively to the isolates from North America (AF037268) and Southern Brazilian (AF438411). Considering the whole genome, the main variation found was one amino acid change at position 2766 (F2766Y). These preliminary data indicate the existence of a natural variation among GLRaV-3 isolates from grapevines. This could be due to the vegetative propagation and long cycle of the plant, associated with the error-prone nature of RNA-dependent RNA polymerase.

A cultura de tecidos tem sido utilizada como ferramenta para gerar e selecionar variabilidade genética que confira maior tolerância das espécies cultivadas à salinidade. Plantas de abacaxi das variedades Pérola e Smooth Cayenne foram micropropagadas em meio de cultura contendo zero, 12,5 e 25 mM de NaCl e avaliadas durante a fase de aclimatação quanto às alterações induzidas pelo NaCl durante o cultivo in vitro e para determinar o melhor parâmetro para quantificar estas alterações. Foram avaliados os caracteres altura das plantas, diâmetro da roseta foliar, número de folhas, comprimento e largura da folha ‘D’ aos 0, 15, 45, 75 e 105 dias após a instalação do experimento. Observou-se que as plantas micropropagadas em meio com NaCl e sem NaCl apresentaram médias e taxas de crescimento semelhantes, mas diferiram quanto às correlações entre os caracteres e às variâncias fenotípicas. Os resultados indicaram que a variância fenotípica foi o parâmetro mais adequado para avaliar o impacto da seleção in vitro sobre caracteres aparentemente não relacionados com a salinidade em plantas de abacaxi.

Plant tissue culture has been used to induce and select genetic variability in order to increase the level of salinity tolerance in several species. Pineapple plants from Pérola and Smooth Cayenne varieties were micropropagated for six months in a medium with 0, 12.5 and 25 mM of NaCl and evaluated during the acclimatization phase to verify the changes induced by NaCl during in vitro cultivation and to determine the best parameter to quantify these changes. The traits evaluated for plant height, plant diameter, leaf number, length and width of the D leaf at 0, 15, 45, 75 and 105 days after the installation of the experiment. There was no effect of different levels of NaCl during the micropropagation on the traits and mean growing rates. Differences were found in the correlation coefficients between the characters and mainly, in the phenotypic variances. The results indicated that the phenotypic variances were more adequate to evaluate the impact of in vitro selection for NaCl tolerance on traits apparently not related to salinity in pineapple plants.

O efeito do agente causal do crestamento bacteriano comum na eficiência fotossintética e na produção do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) foi quantificado. Dois experimentos de campo foram conduzidos durante a safra das águas de 1997, em Piracicaba-SP, com duas cultivares, IAC-Carioca e Rosinha. Diferentes níveis de severidade foram obtidos variando-se o número de inoculações com o patógeno. A severidade da doença, avaliada com auxílio de escala diagramática, não apresentou relação linear significativa (P>0,01) com a produção, enquanto a duração da área foliar sadia (HAD) relacionou-se linearmente de forma significativa (P<=0,01) com a produção nos dois experimentos (R² entre 0,66 e 0,78). A fotossíntese foi relacionada com área foliar doente por meio da equação Px/P0=(1-x )beta, onde Px é a fotossíntese líqüida da folha com severidade x, P0 é a fotossíntese líquida média das folhas sadias, x é a severidade da doença e beta expressa a relação entre lesão virtual e lesão visual. Os valores de beta, determinados por regressão não-linear, foram de 3,19±0,14 e 3,08±0,18 para as cultivares IAC-Carioca e Rosinha, respectivamente. A incorporação de beta ao cálculo de HAD, de modo geral, não melhorou significativamente o ajuste dos dados.

The effect of common bacterial blight on photosynthetic efficiency and on common bean (Phaseolus vulgaris) yield was quantified. Two experiments were carried out during the wet season of 1997 at Piracicaba-SP using two cultivars, IAC-Carioca and Rosinha. Different levels of severity were obtained by varying the number of inoculations with the pathogen. Disease severity, assessed with a diagrammatic scale, did not show a significant linear relationship (P>0.01) with yield, while the healthy leaf area duration (HAD) was significantly (P<=0.01) linear in relation to yield in both experiments (R² between 0,66 and 0,78). Photosynthesis was related to diseased leaf area by the equation Px/P0=(1-x )beta, where Px is the net photosynthesis of the leaf with severity x, P0 is the mean net photosynthesis of the healthy leaves, x is the disease severity, and beta is the relation between virtual and visual lesion. The values of beta, determined by non-linear regression, were 3.08±0.18 and 3.19±0.14 for IAC-Carioca and Rosinha, respectively. In general, the use of beta did not significantly improve the HAD-yield relationship.